Steven Spielberg filmjeinél bevett szokás, hogy a lehető legkésőbbi időpontig titokban tartják a részleteket, különösen ami a film cselekményét illeti - de az új Indiana Jones film körül tapasztalható titkolózás minden korábbi példát felülmúl.
„Ez a legtitkosabb film, ami valaha is készült. Még FBI ügynökök is vannak köztünk a forgatáson!”, mondta az egyik főszereplő, Cate Blanchett, akinek természetesen a pontos szerepét sem tudni, és csak sejteni lehet, hogy a negatív hősnőt alakítja majd.Hála a nagy titkolózásnak és a negyedik rész hivatalos címe megszellőztetésének, máris elkezdődött a spekuláció a cselekményt illetően – vagyis bevált Spielberg és a producerként serénykedő George Lucas számítása – , amelybe még egy harvardi professzor, Marc Zender is beszállt. Zender szerint a cím alapján – Indiana Jones és a kristálykoponya királysága – valószínűsíthető, hogy dr. Jones több, mágikus erővel bíró, az ősi maják, vagy egy még korábbi civilizáció által készített kristálykoponya nyomába ered valahol Közép-Amerikában, csakhogy a koponyák egyszerre hozhatnak halált másokra és végtelen tudást birtokosukra, ami elég veszélyes kombináció.
Mindez visszatérést jelentene az első részhez, melynek egy része szintén ebben a régióban játszódott. Szintén újra láthatjuk majd a vásznon Marion Ravenwoodot (Karen Allen), Indy régi szerelmét is.